== Uso de RStudio en el HPC ==

Lo primero que debemos hacer es descargarnos el contenedor con {{{R}}} y {{{RStudio}}}

{{{singularity pull docker://rocker/rstudio:4.5.1}}}

''En el momento de redacción de este documento, este contenedor contiene las últimas versiones disponibles y es con la que se ha probado que el procedimiento aquí descrito funciona.''

Una vez descargado ejecutamos el siguiente comando:

{{{rserver-hpc <contenedor_rserver> <ubicacion_r>}}}

donde {{{<contenedor_rserver>}}} hace referencia al contenedor (fichero .sif) que nos descargamos al inicio, mientras que {{{<ubicacion_r>}}} se corresponde con el directorio donde se guardarán los paquetes que se instalen desde RStudio Server. Por ejemplo:

{{{rserver-hpc rstudio_4.5.1.sif r_hpc}}}

Una vez lo ejecutemos nos aparecerá un mensaje similar a {{{Submitted batch job <jobid>}}}, donde {{{<jobid>}}} es el ID asignado por {{{Slurm}}} a nuestro proceso. En el mismo directorio donde ejecutásemos el comando anterior se nos habrá creado un fichero llamado {{{slurm-<jobid>.out}}} donde figuran las instrucciones para conectarnos a {{{RStudio Server}}}.

El fichero debería ser similar al siguiente:

{{{
Abre tu navegador web en http://login.hpc.uco.es:8003/rstudio/193458

Accede con tu usuario y la siguiente contraseña: ***

Cuando termines de usar RStudio Server, finaliza el trabajo del siguiente modo:

    1. Sal de la sesión de RStudio (botón de "apagado" en la esquina superior derecha de la ventana de RStudio)
    2. Ejecuta el siguiente comando en el nodo de login:

        scancel -f 193458
}}}

Algunos apuntes a tener en cuenta:
- Aunque el nombre de usuario sea el que se usa para acceder al HPC, la contraseña es distinta y se genera de forma aleatoria cada vez que lanzamos {{{rserver-hpc}}}
- Es muy importante cerrar la sesión y finalizar el proceso una vez deje de usarse. Los técnicos del HPC podrán finalizar procesos de {{{RStudio Server}}} inactivos sin previo aviso