Changes between Version 2 and Version 3 of rstudio

Timestamp:

Oct 9, 2025, 12:20:49 PM (7 days ago)

Author:

i22balur

Comment:

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rstudio

@@ -1 +1 @@
 == Uso de RStudio en el HPC ==
 
-Lo primero que debemos hacer es descargarnos el contenedor con {{{R}}} y {{{RStudio}}}
+Para acceder a RStudio debemos ejecutar el siguiente comando:
 
-{{{singularity pull docker://rocker/rstudio:4.5.1}}}
+{{{rserver-hpc <ubicacion_r>}}}
 
-''En el momento de redacción de este documento, este contenedor contiene las últimas versiones disponibles y es con la que se ha probado que el procedimiento aquí descrito funciona.''
+donde {{{<ubicacion_r>}}} se corresponde con el directorio donde se creará el espacio de trabajo de RStudio. Entre otras cosas, en dicho directorio se guardarán los paquetes que se instalen desde RStudio Server. 
 
-Una vez descargado ejecutamos el siguiente comando:
+Por ejemplo:
 
-{{{rserver-hpc <contenedor_rserver> <ubicacion_r>}}}
-
-donde {{{<contenedor_rserver>}}} hace referencia al contenedor (fichero .sif) que nos descargamos al inicio, mientras que {{{<ubicacion_r>}}} se corresponde con el directorio donde se guardarán los paquetes que se instalen desde RStudio Server. Por ejemplo:
-
-{{{rserver-hpc rstudio_4.5.1.sif r_hpc}}}
+{{{rserver-hpc /home/rbarbudo/workspace-rserver}}}
 
 Una vez lo ejecutemos nos aparecerá un mensaje similar a {{{Submitted batch job <jobid>}}}, donde {{{<jobid>}}} es el ID asignado por {{{Slurm}}} a nuestro proceso. En el mismo directorio donde ejecutásemos el comando anterior se nos habrá creado un fichero llamado {{{slurm-<jobid>.out}}} donde figuran las instrucciones para conectarnos a {{{RStudio Server}}}.